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Equipement de la plateforme ICE

Bioanalyzer 2100

Le Bioanalyzer 2100 (Agilent) est un instrument qui permet l'électrophorèse capillaire de l'ADN et de l'ARN. Il utilise des puces microfluidiques à usage unique ('Lab-On-Chip'). Cet équipement est utilisé pour les étapes de contrôle de qualité avant marquage et après marquage, et fournit une information qui est de type qualitatif. Plusieurs types de puces microfluidiques sont disponibles :

• Kits 'DNA 1000' et 'DNA 7500' : pour évaluer la qualité des ADN à concentration standard (de 0.1 à 50 ng/µl)

• Kit 'High Sensitivity DNA' : pour évaluer la qualité des ADN faiblement concentrés (de 5 à 500 pg/µl)

• Kit 'RNA 6000 Nano' : pour évaluer la qualité des ARN (25 à 500 ng/µl)

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QUANTSTUDIO

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Cryostat

Le cryostat permet de découper les échantillons de tissus contenant les cellules d'intérêt  congelées à -80°C en fines tranches  .

Le Shandon Cryotome® FSE est particulièrement bien adapté pour la coupe de tissus congelés. La régulation rapide de la température assure la qualité des coupes en préservant la stabilité des échantillons.

Ses principales caractéristiques sont :

  • Réfrigération cryobar : 0°C à -55°C.
  • Réfrigération cryochambre: 0°C à -35°C en moins de 2h.
  • Réfrigération échantillon : 0°C à -40°C
  • Fumigation programmable au formol pour décontamination

 

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TapeStation

Le système Agilent TapeStation 2200 propose un débit d’échantillon modulable et des résultats rapides.                Il constitue une solution idéale pour le contrôle de qualité (CQ) d’échantillons biologiques lors de séquençage nouvelle génération (NGS), les puces à ADN et les qPCR ainsi que la purification des protéines et la production d’anticorps.

Le système TapeStation 2200 utilise des ScreenTape, de la taille d’une carte de crédit, disponibles pour les applications ADN, ARN et protéines.

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Nanodrop

Le spectrophotomètre NanoDrop ND-1000 permet de réaliser des spectres d’absorbance en utilisant des petits volumes d'échantillons sans cuvettes ni capillaires.

Il permet des mesures sur une grande gamme de longueurs d'onde pour l’analyse des spectres dans le visible et l’U.V.

Cet appareil est spécialement conçu pour évaluer la pureté et la quantité des acides nucléiques en solution. Le NanoDrop ND-1000 se caractérise par un système de rétention d'échantillon qui permet l'analyse quantitative et qualitative à partir de seulement 1 à 2 µl d’ARN.

La préparation de l'appareil pour la mesure des échantillons ne requiert que le nettoyage des surfaces de lecture.

Son utilisation ne nécessite aucun consommable.


- Gamme spectrale : 220-750 nm.
- Précision : 1 nm.
- Bande passante : 3 nm.
- Sensiblilité : acides nucléiques de 2 à 3700 ng/µl sans dilution.
- Temps de mesure: moins de 30 secondes.

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Primer Express

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Extraction RNA

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qPCR 7900HT

La PCR quantitative en temps réel (qPCR) est une méthode simple, rapide, sensible, reproductible et fiable qui permet de détecter de très faibles quantités d’acides nucléiques (ADN ou ARN) dans une large gamme d’échantillons provenant d’organismes, de tissus ou de cellules très différents.

La qPCR est un outil puissant pour produire et analyser des données pour une grande variété d'applications comprenant des études d'expression de gènes (analyse primaire ou validation des données de microarray ou de NGS) ou de discrimination allélique (génotypage de SNP par TaqMan ou Génotypage ISBP (Insertion Site Based Polymorphisms).

Le système est équipé pour travailler avec :

  • des plaques au format 96 puits
  • la technologie TaqMan Low Density Array (TLDA®) ou TaqMan® Arrays (384-Well Micro Fluidic Cards) Applied Biosystems).

 

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Microdissection XT

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Microdissection VERITAS

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